La Cour de cassation a aussi ordonné la tenue d'un nouveau procès de M. Morsi devant une cour criminelle.
L'ex-chef de l'Etat avait été condamné à la peine de mort en juin 2015 pour son rôle dans des évasions massives de prison et des attaques qui ont fait tomber le régime de Hosni Moubarak en 2011.
Elu président en 2012, Mohamed Morsi a été écarté du pouvoir par l'armée un an plus tard, à la suite de manifestations contre son gouvernement.
La Cour de cassation a aussi annulé les condamnations de cinq de ses co-accusés, dont l'ancien guide suprême des Frères musulmans, Mohamed Badie.
Cette confrérie est déclarée "organisation terroriste" par les autorités égyptiennes, depuis fin 2014.
Les condamnations à la prison à perpétuité de 21 autres détenus ont également été annulées.
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